Алгоритм отображает закономерности деградации белков для улучшения диагностики и лечения инфекций.

Пептиды представляют собой небольшие фрагменты белков, преимущественно встречающиеся в коже и слизистых оболочках. Некоторые пептиды действуют как барьер, защищая организм от инфекций, борясь с такими микроорганизмами, как бактерии, вирусы и другие патогены, тогда как другие участвуют в регуляции воспаления.

Когда у нас есть рана или мы перенесём операцию, этот баланс иногда может быть нарушен, позволяя микроорганизмам проникнуть и вызвать острую инфекцию и, в худшем случае, сепсис.

«Чтобы иметь возможность диагностировать инфекции сегодня, врач сначала проводит клиническую оценку, а затем отправляет образец культуры для дальнейшего анализа. Обычно требуется пара дней, чтобы получить результаты о том, какие бактерии присутствуют в ране, и это не всегда дают четкую картину тяжести инфекции», — говорит Артур Шмидтхен, профессор дерматологии и венерологии Лундского университета и консультант университетской больницы Сконе, Швеция.

В инфицированной ране происходит борьба между иммунной системой и бактериями. Бактерии расщепляют белки на пептиды, чтобы получить питательные вещества и распространить их, в то время как организм использует аналогичные стратегии для борьбы с бактериями и регулирования воспаления. Это взаимодействие невероятно сложное, на него влияют типы присутствующих бактерий, а также тяжесть инфекции.

Исследовательская группа стремилась понять закономерности деградации белков, чтобы быстрее идентифицировать вовлеченные бактерии и оценить риск сепсиса. Рост устойчивости к антибиотикам также увеличил спрос на альтернативные способы диагностики и борьбы с инфекциями. Работа опубликована в журнале Nature Communications.

«Чтобы исследовать количество и типы пептидов в ране, мы «выдавливали» пептиды из раневых повязок, а затем анализировали их с помощью масс-спектрометрии. Это позволило нам идентифицировать до 45 000 различных пептидов из одной инфицированной раны», — говорит Йохан Мальмстрем, профессор масс-спектрометрии Лундского университета.

исследователей является проведение более масштабных исследований для дальнейшей проверки результатов, совершенствования методологии и анализа других типов заболеваний, таких как сепсис. Они также хотят изучить, как этот метод можно применить клинически в реальных диагностических ситуациях, чтобы оценить его практическую полезность.